この度は、当社次世代シーケンシングサービスへのお問い合わせ、誠にありがとうございます。ご意向のNGS解析プロジェクトにつきまして、フォームに従ってご回答ください。
(*の項目は必須回答項目です)
※「トヨタ自動車ソフトウェアによるアンプリコンの解析」では、以下の結果を納品いたします。・アンプリコンの有無をベースにしたジェノタイピング判定結果・アンプリコンのマッピング位置情報(※リファレンスゲノム配列が利用可能な場合に出力されます。)・共優性マーカーの判別情報(※分離集団、2倍体、両親ホモ、子サンプルが40サンプル以上の場合のみ検出可能です。)
解析結果のイメージについて、詳しくは下記URLをご参考ください。https://eurofinsgenomics.jp/jp/service/ngs/gras-di_2/
※「SNP抽出解析」では以下の結果を納品いたします。・マッピング解析結果(bam形式)・SNP抽出結果(vcf形式)
※リファレンスゲノム配列が無い場合には実施できません。※リファレンスゲノム配列が染色体レベルに纏まっていない場合には、納期を追加させて頂く場合がございます。
<ご参考> NCBI Genomeの公開サイトのURLを取得する例
<ご参考> NCBI Genomeで参照ゲノム配列のダウンロードURLを取得する例
分離集団の場合には、分離比をご記入ください(例:AA:Aa:aa=1:2:1の場合は「3:1」とご記載ください)。
※分離比のご指定が有りません場合には「共優性マーカーの判別情報」は出力できません。
「共優性マーカーの判別情報」は「分離集団、2倍体、両親ホモ、子サンプルが40サンプル以上の場合」のみ検出可能です。
※GRAS-Di PCRに使用するランダムプライマーのセットについて、詳しくは下記をご参考ください。
ご記入例(3つの条件をご指定頂く場合)
test1:#1-#48 分離集団 test2:#49-#96 分離集団 test3:#1-#96 自然集団
※ゲノムDNAサンプルに対象生物種以外のバクテリア等のゲノムも混入していますと、対象生物種由来のアンプリコンだけでなく、混入したバクテリア等のゲノムに由来するアンプリコンも増えてくる可能性がございます。
【対応容器のご案内】
不備がある場合には、他のお客様のサンプルとの取り違え事故等を防止する観点から、解析のご依頼は承れません。
※省略された場合には、弊社の他部門で誤って処理される等の事故につながる恐れがあります。その際の事故について、弊社では一切責任を負いかねます。予めご了承ください。
ご参考:次世代シーケンス 参考文献
https://eurofinsgenomics.jp/jp/service/ngs/reference.aspx#gras-di
ご回答ありがとうございます。
内容を確認後、担当者より改めてご連絡いたします。
下記の送信ボタンを押して送信を完了してください。
ご注文内容確認メールが届きます(※)。
※確認メールが届きません場合には、下記までご連絡ください。
ユーロフィンジェノミクス株式会社次世代シーケンシングサービス プロダクトサポートPhone: 03-6631-0106Email: ngs-jp@eurofins.comWebsite: eurofinsgenomics.jp ☆facebook:www.facebook.com/eurofinsgenomicsjp